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Protection sociale des fonctionnaires vs régime général

Depuis la réforme de 2020, les fonctionnaires relèvent du régime général de la Sécurité sociale pour la maladie. Mais leur statut particulier leur confère des droits supplémentaires importants, notamment en matière de maintien de salaire et de congés maladie.

Maladie ordinaire : délai de carence et maintien de traitement

Contrairement aux salariés du privé qui subissent un délai de carence de 3 jours non indemnisés par la sécu, les fonctionnaires titulaires ont un avantage majeur : aucun délai de carence pour le maintien de leur traitement. L'employeur public maintient le traitement dès le 1er jour.

En revanche, depuis 2012, un jour de carence s'applique en cas de congé de maladie ordinaire dans la fonction publique (non remboursé par l'État). Ce jour de carence unique est bien inférieur aux 3 jours du privé.

Durées et niveaux de maintien selon le type de congé

Type de congéDurée totale max.Traitement pleinDemi-traitementPathologies concernées
Congé Ordinaire de Maladie (COM)12 mois / 3 ans3 mois9 moisToute maladie
Congé Longue Maladie (CLM)3 ans1 an2 ansMaladies graves (liste)
Congé Longue Durée (CLD)5 ans3 ans2 ansTuberculose, cancer, ALD grave
Accident de serviceIllimitéTotalité0AT dans l'exercice des fonctions
Maladie professionnelle (FP)IllimitéTotalité0Maladie liée au service

Invalidité : rente d'invalidité vs pension d'invalidité

Le fonctionnaire inapte définitif à ses fonctions bénéficie d'une mise en retraite pour invalidité (et non d'une pension d'invalidité sécu). Le montant dépend des années de service et du taux d'invalidité reconnu par le comité médical.

Les fonctionnaires contractuels relèvent eux des mêmes règles que les salariés du privé (pension d'invalidité sécu cat. 1, 2 ou 3).

Mutuelle : la participation employeur public

Depuis janvier 2022 (FPE) et 2025 (FPT), l'employeur public est obligé de participer à la mutuelle de ses agents à hauteur d'au moins 50 % du montant de référence. Cette harmonisation avec le privé améliore la couverture des fonctionnaires.

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Retraite : toujours un régime spécifique

Pour la retraite, les fonctionnaires titulaires restent affiliés à la CNRACL (territoriale et hospitalière) ou au SRE (État), des régimes distincts du régime général. Le calcul de la pension se fait sur les 6 derniers mois de traitement indiciaire, et non sur les 25 meilleures années comme dans le privé.

Questions fréquentes

Un fonctionnaire bénéficie-t-il du maintien de salaire en cas d'arrêt maladie ?

Oui. Un fonctionnaire titulaire bénéficie d'un maintien de traitement intégral pendant 3 mois (congé ordinaire de maladie), puis à demi-traitement les 9 mois suivants, sans délai de carence.

Le fonctionnaire est-il affilié à la Sécurité sociale ?

Oui, les fonctionnaires sont affiliés au régime général de la Sécurité sociale depuis 2020 pour la maladie. Ils cotisent et bénéficient des mêmes prestations maladie que les salariés du privé.

Quelle est la différence entre CLM et CLD pour un fonctionnaire ?

Le Congé Longue Maladie (CLM) dure jusqu'à 3 ans ; le Congé Longue Durée (CLD) va jusqu'à 5 ans pour certaines pathologies graves. Le traitement est maintenu à taux plein puis demi-traitement selon la durée.